瑞安市财政、地税部门实行合署办公，一套班子。财政部门由地方政府直接管理，地税部门由上级地税局垂直管理。全局内设办公室、人教科、监察科、预算科、行事科、社保科、农财科、企财科、税政科、征管科、计财科、法规科等21个科室，下属瑞安市会计核算中心、瑞安市预算外资金管理中心、瑞安市财政投资评审中心等11个事业单位，下设1个稽查局、6个税务分局。全局在职人员379人，其中大专以上文化程度322人。

近年来，瑞安市财政、地税局积极调整发展思路，积极转变财税扶持方式和方向，推进产业结构优化升级，财税反哺经济水平进一步提高；努力压缩一般支出，倾向民生工程，保障重点支出，促进和谐社会建设，财政支出结构进一步优化；认真落实间接税源控管，实现“人对事、事对户”征管新模式，强化 “双向监管、以票管税”，推进社会化综合治税，税费征管手段进一步精细化；稳步实施乡镇财政管理方式改革，推进土地出让金监管改革，深化国有资产监管体制改革，推行财政支出绩效评价改革，财税运行机制进一步完善；以作风建设年活动为抓手，以争创“五型”机关为载体，以提升干部综合素质为核心，加强队伍建设，财税工作效能和形象进一步提升。

近年来，瑞安市财政、地税局在瑞安市市级部门和行业行风建设民主评议活动中名列前茅；塘下税务分局、莘塍税务分局、马屿税务分局、陶山税务分局办税服务厅被评为浙江省、温州市“青年文明号”，塘下税务分局、仙降税务分局、陶山税务分局被省地税局授予“基层文明单位”，稽查局被评为省级地税稽查工作先进集体，塘下税务分局、陶山税务分局、仙降税务分局、马屿税务分局被温州市局评为“基层文明单位”的荣誉。